ChemSpider
![]() | |
---|---|
함유량 | |
기술 | 1 억 개 이상의 구조, 속성 및 관련 정보에 대한 빠른 액세스를 제공하는 화학 구조 데이터베이스입니다. |
접촉 | |
연구 센터 | Raleigh, 노스 캐롤라이나 , 미국 |
실험실 | |
접속하다 | |
웹 사이트 | www.chemspider.com |
도구 | |
독립형 | https://itunes.apple.com/us/app/chemspider/id458878661 |
여러 가지 잡다한 | |
특허 | Creative Commons Attribution 유사 공유 [2] |
ChemSpider 는 화학 물질 데이터베이스입니다 . ChemSpider는 Royal Society of Chemistry 가 소유하고 있습니다. [3] [4] [5] [6] [7]
데이터베이스 [ 편집 ]
데이터베이스에는 다음을 포함한 270 개 이상의 데이터 소스에서 1 억 개 이상의 분자 에 대한 정보가 포함되어 있습니다 . [8]
- EPA DSSTox [9]
- 미국 식품의 약국 (FDA)
- 인간 대사 체 데이터베이스
- 이종 고리 화학 저널
- 케그
- KUMGM
- LeadScope
- LipidMAPS
- 마린 릿
- MDPI
- MICAD
- MLSMR
- MMDB
- MOLI
- MTDP
- 나노 젠
- 자연 화학 생물학
- NCGC
- NIAID
- 국립 보건원 (NIH)
- NINDS 승인 약물 검사 프로그램
- NIST
- NIST 화학 웹북
- NMMLSC
- NMRShiftDB
- 깃털 장식
- PCMD
- PDSP
- 펩티드
- Prous Science Drugs of the Future
- QSAR
- R & D 화학
- 화학 유전체학을위한 샌디에고 센터
- SGCOxCompounds, SGCStoCompounds
- SMID
- 명세서
- 구조 유전체학 컨소시엄
- SureChem
- 신 톤랩
- Thomson Pharma
- 총 TOSLab 빌딩 블록
- UM-BBD
- UPCMLD
- 유용한 화학
- Web of Science
- xPharm
각 화학 물질 에는 해당 URL의 일부를 형성 하는 고유 식별자 가 제공 됩니다. 예를 들어 아세톤 은 175이므로 URL은 http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.175.html입니다.
크라우드 소싱 [ 편집 ]
ChemSpider 데이터베이스는 화학 구조 증착, 스펙트럼 증착 및 사용자 큐 레이션을 포함한 사용자 기여로 업데이트 할 수 있습니다 . 이것은 온라인 화학 데이터베이스를 개발하기위한 크라우드 소싱 접근 방식입니다. 크라우드 소싱 기반의 데이터 큐 레이션은 생의학 및 화학 문헌의 텍스트 마이닝 응용 프로그램에 사용 된 화학 구조와 관련된 화학 이름 사전 을 생성했습니다 . [10]
그러나 데이터베이스 권한 은 포기되지 않으며 데이터 덤프 를 사용할 수 없습니다. 사실, FAQ에는 제한된 다운로드 만 허용된다고 명시되어 있습니다. [11] 따라서 포크 권한 이 보장되지 않으며 프로젝트가 무료 / 공개 로 간주 될 수 없습니다 .
검색 [ 편집 ]
사용 가능한 여러 검색 모듈이 제공됩니다.
- 표준 검색 할 수 있습니다 쿼리 에 대한 체계적인 이름 , 상표 이름 과 동의어 및 레지스트리 번호
- 고급 검색 과 같은 분자식 사용하고, 화학 구조, 하부 화학적으로 상호 작용을 검색 할 수 있습니다 분자량 범위 CAS의 번호, 공급자 등의 검색이 확대 또는 이미 찾은 결과를 제한하는 데 사용될 수있다.
- 모바일 장치에서 구조 검색은 iOS (iPhone / iPod / iPad) [12] 및 Android (운영 체제) 용 무료 앱을 사용하여 수행 할 수 있습니다 . [13]
화학 문서 마크 업 [ 편집 ]
ChemSpider 데이터베이스는 화학 문서 마크 업 의 기초로 텍스트 마이닝 과 함께 사용되었습니다 . ChemMantis, [14] Chemistry Markup and Nomenclature Transformation Integrated System은 알고리즘을 사용하여 문서와 웹 페이지에서 화학 이름을 식별 및 추출 하고 ChemSpider에서 이름-구조 변환 알고리즘 및 사전 조회 를 사용하여 화학 구조로 화학 이름을 변환합니다. 데이터 베이스. 그 결과 화학 문서와 ChemSpider를 통한 150 개 이상의 데이터 소스에 대한 정보 조회 간의 통합 시스템이 탄생했습니다.
역사 [ 편집 ]
ChemSpider는 2009 년 5 월 RSC ( Royal Society of Chemistry )에 인수되었습니다 . [15] RSC에 인수되기 전에 ChemSpider는 민간 기업인 ChemZoo Inc에서 관리했습니다.이 시스템은 2007 년 3 월 베타 릴리스 로 처음 출시 되었습니다. 2008 년 3 월에 출시되었습니다.
서비스 [ 편집 ]
많은 서비스가 온라인으로 제공됩니다. 여기에는 화학 이름을 화학 구조로 변환 , SMILES 및 InChI 문자열 생성, 많은 물리 화학적 매개 변수 예측 및 NMR 예측을 허용하는 웹 서비스에 대한 통합이 포함됩니다 .
SyntheticPages [ 편집 ]
SyntheticPages는 Royal Society of Chemistry 에서 운영하는 합성 화학 절차 의 무료 대화 형 데이터베이스입니다 . [16] 사용자는 사이트에 게시하기 위해 자신이 수행 한 합성 절차를 제출합니다. 이러한 절차는 독창적 인 작업 일 수 있지만 더 자주 문헌 반응을 기반으로합니다. 적절한 경우 원래 게시 된 절차에 대한 인용 이 이루어집니다. 게시하기 전에 과학 편집자가 확인합니다. 페이지는 과학 저널 처럼 공식적인 동료 검토를 거치지 않습니다.로그인 한 사용자가 댓글을 작성할 수 있습니다. 의견은 과학 편집자들에 의해 조정됩니다. 목적은 실험실에서 유용한 화학 합성 을 수행하는 방법에 대한 실제 경험을 수집하는 것입니다 . 일반 학술지에 게재 된 실험 방법 은 공식적으로 간결하게 나열되어 있지만 ChemSpider SyntheticPages의 절차는보다 실용적인 세부 사항과 함께 제공됩니다. 비공식이 권장됩니다. 제출자의 의견도 포함됩니다. 비교 가능한 양의 세부 사항이있는 다른 출판물에는 Organic Syntheses 및 Inorganic Syntheses가 포함 됩니다. SyntheticPages 사이트는 원래 Kevin Booker-Milburn ( 브리스톨 대학교) 교수 , Stephen Caddick (University College London ), Peter Scott ( University of Warwick ) 및 Dr Max Hammond. 2010 년 2 월에 Royal Society of Chemistry의 화학 구조 검색 엔진 ChemSpider와 합병이 발표되고 [17] ChemSpider | SyntheticPages (CS | SP)가 형성되었습니다.
PHACTS 열기 [ 수정 ]
ChemSpider 는 Innovative Medicines Initiative 인 Open PHACTS 프로젝트의 일부로 화합물 저장소 역할을했습니다 . 개방형 표준을 위해 개발 된 개방형 PHACTS는 서로 다른 정보 소스, 표준 부족 및 정보 과부하와 같은 저분자 약물 발견의 병목 현상을 해결하기 위해 개방형 액세스, 의미 론적 웹 접근 방식을 사용합니다. [18]
참조 [ 편집 ]
![]() | Wikidata 에는 다음과 같은 속성이 있습니다.
|
- NIST
- PubChem
- DrugBank
- 체비
- ChEMBL
- 분자 모델링 용 소프트웨어
참고 문헌 [ 편집 ]
- ↑ Van Noorden, R. (2012). "화학의 데이터 웹 확장" . 자연 . 483 (7391) : 524. Bibcode : 2012Natur.483..524V . 도이 : 10.1038 / 483524a . PMID 22460877 .
- ^ "ChemSpider 블로그»블로그 아카이브»ChemSpider는 크리에이티브 커먼즈 라이센스를 채택합니다" . www.chemspider.com . 2015 년 4 월 2 일 에 원본 문서 에서 보존 된 문서 . 만회 2014년 3월 21일을 .
- ↑ Antony John Williams (2008 년 1 월 ~ 2 월). "ChemSpider 및 확장 웹 : 화학자를위한 구조 중심 커뮤니티 구축" . 화학 국제 . 30 (1).
- ↑ Williams, AJ (2008). "공공 화합물 데이터베이스". 신약 발견 및 개발에 대한 현재 의견 . 11 (3) : 393–404. PMID 18428094 .
- ↑ Brumfiel, G. (2008). "화학자들은 데이터 웹을 돌 립니다 " . 자연 . 453 (7192) : 139. Bibcode : 2008Natur.453..139B . 도이 : 10.1038 / 453139a . PMID 18464701 .
- ↑ Williams, AJ (2011). "Chemspider : 공용 복합 데이터베이스에서 파생 된 데이터를 선별하기위한 크라우드 소싱 협업 플랫폼". 생물 의학 연구를위한 협업 컴퓨팅 기술 . 363–386 쪽. DOI : / 9781118026038.ch22 10.1002을 . ISBN 9781118026038.
- ^ 펜스, 그는; Williams, A. (2010). "ChemSpider : 온라인 화학 정보 리소스". Journal of Chemical Education . 87 (11) : 1123. Bibcode : 2010JChEd..87.1123P . DOI : 10.1021 / ed100697w을 .
- ^ "데이터 소스" . Chemspider . 만회하는 5 월 (16), 2019 .
- ^ "ChemSpider 블로그»블로그 아카이브»미국 EPA DSSTox 브라우저는 ChemSpider에 연결합니다" . ChemSpider. 8 월 23 일에서 2008 년 보관 원래 2017년 11월 7일에 . 2017 년 11 월 7 일에 확인 함 .
- ↑ Hettne, KM; Williams, AJ; EM, Van Mulligen; Kleinjans, J .; Tkachenko, V .; Kors, JA (2010). "다중 소스 화학 사전의 자동 및 수동 큐 레이션 : 텍스트 마이닝에 미치는 영향" . Journal of Cheminformatics . 2 (1) : 3. doi : 10.1186 / 1758-2946-2-3 . PMC 2848622 . PMID 20331846 .
- ^ "ChemSpider 블로그»블로그 아카이브»누가 전체 ChemSpider 데이터베이스를 갖고 싶습니까?" . www.chemspider.com . 2015 년 9 월 24 일 에 원본 문서 에서 보존 된 문서 . 만회 2014년 4월 18일을 .
- ^ "App Store에서 제공하는 ChemSpider" . 앱 스토어 .
- ^ "ChemSpider Mobile-Google Play의 Android 앱" . play.google.com .
- ^ ChemZoo에 오신 것을 환영합니다 ChemMantis와 커뮤니티에서 기부 요청, 2008-10-23, A. Williams, 블로그 게시물 2015-09-24 Wayback Machine에 보관 됨
- ^ "RSC는 ChemSpider를 취득합니다" . Royal Society of Chemistry. 2009 년 5 월 11 일 . 만회하는 2009-08-30을 .
- ^ "ChemSpider SyntheticPages" . ChemSpider SyntheticPages . Royal Society of Chemistry . 만회 년 6 월 (26) 2012 .
- ^ "ChemSpider 및 SyntheticPages는 합성 화학을 지원합니다" . RSC 출판 . Royal Society of Chemistry. 2010-02-05. 에서 보관 원래 2012년 7월 26일에 . 만회하는 2012-06-26을 .
- ↑ Williams, AJ ; Harland, L .; Groth, P .; Pettifer, S .; Chichester, C .; Willighagen, EL; Evelo, CT; Blomberg, N .; Ecker, G .; Goble, C . ; Mons, B. (2012). "Open PHACTS : 신약 발견을위한 시맨틱 상호 운용성" . 오늘날의 약물 발견 . 17 (21–22) : 1188–1198. DOI : 10.1016 / j.drudis.2012.05.016을 . PMID 22683805 .